首先，按等级分的话。机电工程施工总承包资质和建筑机电安装工程专业承包资质差别不是很大，等级从高到低可分为一级、二级、三级三个等级。但是办理条件和承包项目范围有很大的不同。机电总承包的资质可以包括建筑机电安装工程的专业承包资质，也大于专业承包资质，所以两者的关系是包含或等于的。

　　其次，从性质上来说。建筑机电安装工程专业承包资质属于专业承包资质序列，而机电工程施工总承包资质属于总承包资质序列，性质明显不同。

　　从办理的条件看也是有区别的。比如申请资质标准不同，机电总承包申请标准和难度都高于专业承包。以同样新设立的三级资质为例，机电总承包资质要求企业净资产达到800万以上，专业承包资质净资产仅需达到400万。此外，机电工程施工总承包资质所需的各类注册人员几乎是机电安装工程专业包资质的两倍。

　　最后，从承接业务范围来看也有不同。机电总承包资质三级可承担单项合同价值1500万元以下的各类机电工程施工，而建筑机电安装工程三级专业承包资质只能承担单项合同价值1000万元以下的各类建筑工程的线路、设备、管道安装，以及非标准钢结构的制作安装。

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